MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori F32 plasmid pHPF32

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017370	AAG	2	6	93	98	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
2	NC_017370	A	6	6	145	150	100 %	0 %	0 %	0 %	386262356
3	NC_017370	TTTA	2	8	184	191	25 %	75 %	0 %	0 %	386262356
4	NC_017370	CAA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262356
5	NC_017370	GAA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
6	NC_017370	AATAC	2	10	471	480	60 %	20 %	0 %	20 %	386262356
7	NC_017370	AAAAG	2	10	484	493	80 %	0 %	20 %	0 %	386262356
8	NC_017370	GAA	2	6	549	554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
9	NC_017370	ACA	2	6	573	578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262356
10	NC_017370	TCAA	2	8	638	645	50 %	25 %	0 %	25 %	386262356
11	NC_017370	TGT	2	6	671	676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262356
12	NC_017370	AT	3	6	686	691	50 %	50 %	0 %	0 %	386262356
13	NC_017370	CCA	2	6	770	775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386262356
14	NC_017370	A	6	6	802	807	100 %	0 %	0 %	0 %	386262356
15	NC_017370	TCA	2	6	914	919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262356
16	NC_017370	ATC	2	6	985	990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262356
17	NC_017370	GCAT	2	8	1007	1014	25 %	25 %	25 %	25 %	386262356
18	NC_017370	AAG	2	6	1022	1027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
19	NC_017370	AGA	2	6	1059	1064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
20	NC_017370	A	7	7	1080	1086	100 %	0 %	0 %	0 %	386262356
21	NC_017370	A	6	6	1120	1125	100 %	0 %	0 %	0 %	386262356
22	NC_017370	CATG	2	8	1134	1141	25 %	25 %	25 %	25 %	386262356
23	NC_017370	A	7	7	1151	1157	100 %	0 %	0 %	0 %	386262356
24	NC_017370	A	7	7	1243	1249	100 %	0 %	0 %	0 %	386262356
25	NC_017370	GAA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
26	NC_017370	ACA	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262356
27	NC_017370	A	6	6	1307	1312	100 %	0 %	0 %	0 %	386262356
28	NC_017370	AAG	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356
29	NC_017370	CAA	2	6	1344	1349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262356
30	NC_017370	AAG	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262356

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.